藏身阿拉斯加荒野多年后，昭通一名专业杀手重出江湖，营救她心心念念，却不得不抛下的女儿。

不久霹雳在一次调停武师之间的冲突时被黑帮杀死，学院新增他的儿子亚朗也面临被杀害的危险，学院新增紧急关头，阿金面无惧色携带亚朗同黑帮展开了一场生死搏斗。来到香港讨生活的大陆武术高手阿金（杨紫琼饰）起初只能去摄影棚做电影替身演员，个本由于身手不凡又能吃苦，个本不久她就成为女武师，与武术指导霹雳（洪金宝饰）成为配合默契的搭档

趁着休假之际，科专杨丽菁来到香港寻人……菁结识了黑帮头子的妹妹李赛凤，科专雄被追杀，缘起一幅藏有惊天秘密的清明上河图，雄跟凤为势所迫，与菁联盟，加入寻宝行列。日本女间谍大岛由加利与神秘女郎西协美智子闻讯赶来夺宝，昭通扑朔迷离的争斗之后，宝落谁手？。在一次围捕黑帮走私团伙的行动中，学院新增公安人员杨丽菁差点命丧黑帮头子之首，关键时刻，一位男子开枪击毙了黑帮头子。

个本杨丽菁认为救她的人是自己的旧情人李子雄愤怒的傅红雪想要杀死马空群，科专却遭到了叶开的阻拦。

白天羽（陈勋奇饰）身为神刀门门主，昭通却意外惨死在边城梅花庵，昭通一晃眼二十年过去，白天羽的儿子傅红雪（狄龙饰）长大成人，练就了一身了得的武功，发誓要为父亲报仇，于是踏上了前往边城，探寻真相的旅途。

叶开（陈勋奇饰）是白天羽和花白凤的儿子，学院新增他于偶然之中同傅红雪相遇，两人结伴而行。调查局机动组组长方国辉（刘德华）为人干练嫉恶如仇，个本与手下对周朝先（梁家辉）经营的电玩场进行监拍时，个本拿到其经营地下赌场的证据，将其告上法庭，岂料法官被收买，周朝先被判无罪当庭释放。

方国辉沮丧之际，科专得电视台女记者凌飞（吴辰君）和法务部冯部长的鼓励重回工作岗位，却被丁宗树盯上，欲将他杀死后再嫁祸周朝先，好一石二鸟。周朝先为进一步控制台湾的政治，昭通在记者会上公开声明要退党参选立法委员，欲与代表党竞选的黑帮老大丁宗树对着干。

与黑金挂勾的侯部长（李立群）暗中施压，学院新增调查局勒令方国辉休假，停止对周朝先的调查火爆黑道争霸激战，个本孤胆英雄独闯黑界。